توجد ثغرة أمنية خطيرة في GNU cflow حتى الإصدار 1.8. تكمن المشكلة في الدالة `yylex` داخل الملف `c.c` الخاص بمكون Lexer وتؤدي إلى حدوث تجاوز سعة المخزن المؤقت (buffer overflow). يتطلب استغلال هذه الثغرة وصولاً محلياً. وقد تم الكشف عن طريقة الاستغلال علنًا.