Várias rotas de issues da API REST não verificam se um repositório está arquivado. Embora a interface web bloqueie alterações em issues e pull requests em repositórios arquivados, um usuário autorizado pode ignorar essas restrições via API para editar, fechar ou excluir issues, alterar etiquetas e prazos, gerenciar tempo rastreado e cronômetros, adicionar reações, alterar bloqueios de issues e fixar issues. Isso permite a alteração de dados que deveriam ser congelados pelo processo de arquivamento.